El área de investigación se crea para prestar apoyo al FIMI en su misión de fortalecer el impacto de las mujeres indígenas en los procesos de toma de decisiones y diálogo global sobre los derechos humanos y los derechos de las mujeres. Los resultados servirán de base técnica para la participación de mujeres indígenas líderes en conferencias regionales e internacionales entre otros.  Los procesos de investigación son conceptualizados desde un enfoque basado en los derechos humanos prestando especial atención a los derechos individuales y colectivos de los pueblos indígenas y de las mujeres indígenas en particular y tomando la Declaración de Naciones Unidas sobre los Derechos de Pueblos Indígenas como instrumento de referencia.

Se propone desarrollar diversas metodologías culturalmente apropiadas y en consonancia con los principios fundamentales del FIMI. En primer lugar, los procesos de investigación respetarán el principio del consentimiento, libre, previo e informado. El consentimiento libre implica que no haya coerción, intimidación ni manipulación, previo implica que se ha tratado de obtener el consentimiento con suficiente antelación a cualquier autorización o comienzo de actividades y que se han respetado las exigencias cronológicas de los procesos de consulta/consenso con los pueblos indígenas, informado implica que se ha proporcionado información precisa y de forma accesible y comprensible, entre otras cosas en un idioma que los pueblos indígenas comprendan plenamente. 

En segundo lugar, el trabajo está guiado por el principio de complementariedad y reciprocidad entre investigadores e investigados. Consideramos a todo ser humano como sujeto activo, potente y capaz de vivir de acuerdo a su historia y contexto cultural en el que se encuentra inmerso, todos los participantes de una investigación se enriquecen y aprenden de los otros.

En tercer lugar, se enfatiza la importancia del respeto a los sistemas del conocimiento tradicional, la sabiduría de los antepasados y personas mayores siendo el diálogo intergeneracional base para el intercambio y análisis de la información.

En cuarto lugar, se establecen mecanismos para que los pueblos indígenas involucrados en una investigación puedan participar plenamente en las diferentes etapas.